化学专业知网查重的原理主要是通过比对文献中的文字内容，检测其中是否存在与已有文献相似的部分。这一过程通常通过计算机程序实现，利用文本相似度算法来判断文献之间的相似程度。一般来说，查重系统会将待检测文献与数据库中的文献进行比对，标记出相似部分，并给出相似度评分。通过这种方式，可以有效检测出文献中的抄袭行为，确保学术作品的原创性。

化学专业知网查重的方法包括内部查重和外部查重。内部查重是指在同一系统内对文献进行查重，主要检测作品内部是否存在重复部分；外部查重则是将待查文献与外部数据库进行比对，查找是否存在外部抄袭。综合利用内外部查重方法可以更全面地保证文献的原创性。此外，化学专业知网查重还会结合人工审核，对查重结果进行进一步确认，确保查重结果的准确性和可靠性。